CV
Education
- Ph.D in Media and Governance, Keio University, 03.2021
- M.S. in Systems Biology, Keio University, 03.2018
- B.S. in Environment and Information Studies, Keio University, 03.2015
Work experience
- 04.2021 - Present : Research Fellow
- The University of Tokyo
- Supervisor: Professor Yuichi Wakamoto
- 04.2014-03.2021: Research Assistant
- Institute for Advanced Biosciences, Keio University
- Duties included: Student mentorship
- Supervisor: Professor Masaru Tomita
Skills
- Omics analysis
- Genome assembly
- Transcriptome and Metabolome analysis
- Genetics using E. coli
- Molecular cloning
- Library construction
- Microscopy
- Lithography for microfluidics
- Time lapse microscopy using microfluidics
- Computational analysis
- Fluent in Perl and R
- Use HPC and cluster servers
Publications
Talks
高線量γ線に対するヨコヅナクマムシの応答解明に向けた経時的微量トランスクリプトーム解析
Oral at 生命情報若手の会 第7回研究会, IAB, Keio University, Yamagata, Japan
ヨコヅナクマムシの乾眠関連遺伝子の網羅的同定へむけて
Oral at 第1回クマムシ学研究会2016, Keio University, Kanagawa, Japan
MetaSUB (Co-author only)
Oral at The 2nd Annual Conference on Metagenomics and MetaSUB, Crowne Plaza, Shanghai, China
ドゥジャルダンヤマクマムシとヨコヅナクマムシの比較ゲノム解析
Oral at SIG-MBI, NAIST, Ishikawa, Japan
SCAR Biology Symposium (Co-author only)
Oral at SCAR Biology Symposium 2017, Campus of Social Sciences of KU Leuven, Leuven, Belgium
Comparative genomics of the tardigrades Hypsibius dujardini and Ramazzottius varieornatus
Oral at ISMB2017, Prague Congress Centre, Prague, Czech Republic
乾眠能力の異なる二種のクマムシの比較ゲノム解析
Oral at 第2回 クマムシ学研究会2017, The University of Tokyo, Tokyo, Japan
Comparative genomics of the tardigrades Hypsibius dujardini and Ramazzottius varieornatus
Oral at 14th International Symposium on Tardigrada, Copenhagen Biocenter, København, Denmark.
短波長紫外線へ曝露されたヨコヅナクマムシのトランスクリプトーム解析
Oral at 第3回クマムシ学研究会2018, Keio University, Kanagawa, Japan
ヨコヅナクマムシとドゥジャルダンヤマクマムシの比較ゲノム解析
Oral at IIBMP2018, 荘銀タクト鶴岡, Yamagata, Japan
短波長紫外線へ曝露された横綱クマムシのトランスクリプトーム解析
Oral at 生命科学系フロンティアミーティング 2018, National Institute of Genetics, Shizuoka, Japan
短波長紫外線に曝露したヨコヅナクマムシのトランスクリプトーム解析
Oral at 第4回クマムシ学研究会2019, Aiming Osaka Studio, Osaka, Japan
発生3日目がクマムシ Hypsibus exemplarisの孵化に重要である
Oral at 日本動物学会 第90回大会 2019, Osaka City University, Osaka, Japan
短波長紫外線に曝露したヨコヅナクマムシのトランスクリプトーム解析
Oral at 生命情報科学若手の会 第11回年会, 山梨県富士吉田市 人材開発センター 富士研修所, Yamanashi, Japan
オミクス解析による緩歩動物特異的な新規抗酸化遺伝子の探索
Oral at 第5回クマムシ学研究会2020, Zoom, Japan
Cap Trap RNA-Seqを用いた乾眠性ユスリカのトランスクリプトーム解析
Oral at 生命情報科学若手の会 第12回年会, Zoom, Japan
A single chromosome driving rapid extremotolerant adaptation in an insect
Oral (International) at Moscow Conference on Computational Molecular Biology, Zoom, Moscow
乾眠能力の異なる二種のクマムシの比較ゲノム解析
Oral at 日本進化学会第23回東京大会, Zoom, Japan
High throughput genotype-phenotype linkage by Raman microscopy
Oral at 第59回 日本生物物理学会年会, Zoom, Japan
ゲノムから紐解く乾眠の進化
Oral at 日本乾眠生物若手の会, Zoom, Japan
High quality genome assembly of the anhydrobiotic midge provides insights on a single chromosome-based emergence of extreme desiccation tolerance
Oral at International Symposium on Chironomids, Zoom, Japan
ネムリユスリカの極限環境適応へ寄与した染色体レベルのゲノムの偏り
Oral at 日本進化学会, Plaza Verde, Numazu, Shizuoka, Japan
ラマン顕微鏡と連続FISHを用いた大腸菌表現型・遺伝子型リンク解析へ向けて
Poster at 第45回日本分子生物学会年会, Makuhari Messe, Makuhari, Japan
ヤマクマムシの交叉耐性機構解明へ向けたDNA損傷剤ブレオマイシン応答のマルチオミクス解析
Oral at 第7回日本クマムシ学研究会, 日本クマムシ学研究会, Japan
トウキョウチョウメイムシの性決定因子同定へ向けたオミクス解析
Oral at 第8回クマムシ学研究会, クマムシ学研究会, Japan
ネムリユスリカの性決定機構解明へ向けた雌雄の比較ゲノム解析
Poster at 第46回日本分子生物学会年会, 神戸国際展示場, Kobe, Japan
ネムリユスリカの性決定に関わるマスター制御因子の探索
Oral at 日本動物学会第95回大会, 日本動物学会, Japan
比較ゲノム解析から探すユスリカの性染色体
Oral at 生殖若手の会, 生殖若手の会, Japan
乾眠可能なユスリカに由来する培養細胞細胞のT2Tゲノム解析へ向けて
Poster at 第47回日本分子生物学会年会, マリンメッセ福岡, Fukuoka, Japan
乾眠生物におけるDNA損傷応答とその影響
Oral at 第70回低温生物工学会大会, 低温生物工学会, Japan
Comprehensive analysis of the DNA mutation landscape in Ramazzottius varieornatus
Oral (International) at 16th International Symposium on Tardigrada, 16th International Symposium on Tardigrada, Japan
Gene integration by recombinase-mediated cassette exchange method in the Anhydrobiotic Pv11 cells
Oral (International) at The Joint Annual Meeting of JSDB and JSCB, The 58th Japan Society of Developmental Biologists and 77th Japan Society for Cell Biology Joint Annual Meeting, Japan
ネムリユスリカの性決定制御因子の探索
Oral at 日本動物学会第96回名古屋大会, 名古屋国際会議場, Nagoya, Japan
Identification of a novel antioxidant gene family in an anhydrobiotic tardigrade
Oral (International) at 1st East Asia Conference on Extremophiles, 1st East Asia Conference on Extremophiles, Japan
乾眠可能細胞Pv11の遺伝子改変技術の拡張
Oral at 第48回日本分子生物学会年会, 神戸国際会議場, Kobe, Japan
乾眠生物の統合的データベース Kanminbase構築に向けて
Oral at 第10回クマムシ学研究会, クマムシ学研究会, Japan
Teaching
Service and leadership
- 2016-2019: Committee member for Japanese Society for Young Bioinformatics Researchers